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文檔簡介
LexA酵母雙雜交系統(tǒng)簡介
一、LexA酵母雙雜交系統(tǒng)的設(shè)計原理
報告質(zhì)粒p8op-LacZ的GAL4UAS編碼序列被完全去除,因此在缺乏LexA融合激
活劑的情況下,報告基因LacZ的轉(zhuǎn)錄活性為零,該基因的篩選標(biāo)志為URA3,可以作為有
自主復(fù)制能力的質(zhì)粒存在于酵母EGY48菌株中,也可以被整合到EGY48基因組DNA上。
質(zhì)粒pLexA的篩選標(biāo)志為HIS3,在雙雜交系統(tǒng)中用于表達(dá)DNA-BD(202個氨基酸殘
基組成的LexA蛋白)與目標(biāo)蛋白(釣餌,Bait)的融合蛋白,該融合體的表達(dá)受酵母強(qiáng)啟動子
ADH1的調(diào)控,選擇與報告基因的操縱子LexAx8結(jié)合。
質(zhì)粒pB42AD的篩選標(biāo)志為TRP1在其供外源基因插入的多克隆位點(EcoRI與Xho
I)上游,含有SV40核定位(SV40nuclearlocalization),HA(血凝素)及AD(來自于的88
個氨基酸殘基組成的B42蛋白)等幾種編碼序列,共同組成可以啟動報告基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)的激
活成份。
在酵母EGY48的基因組中還整合有另一個報告基因Leu,它與LacZ報告基因具有相
同的操縱子-LexA,但兩者啟動子不同。
根據(jù)雙雜交系統(tǒng)的原理,如果某一復(fù)合物同時具有DNA-BD和AD的活性,即可激活
報告基因的轉(zhuǎn)錄和表達(dá)。分別將待測蛋白X、Y的編碼序列插入pLexA質(zhì)粒載體和pB42AD
質(zhì)粒載體的多克隆位點中,然后共同轉(zhuǎn)入含有報告基因的酵母菌株,如果蛋白X與Y能相
互作用,則啟動報告基因的轉(zhuǎn)錄和表達(dá),通過檢測報告基因的表達(dá)情況,就可以間接反映
蛋白X、Y是否具有相互作用以及作用的強(qiáng)弱。
如果將雷白Y換為取自絹織或血液的cDNA文庫,則可用X從該文庫中篩選出能與其
相互作用的蛋白,并且可以獲得編碼這些蛋白的
cDNA0
二、商品化酵母雙雜交系統(tǒng)的組成
載體質(zhì)粒:、、文庫
1.pLexApB42ADp8op-LacZxpB42AD-DNA
2.酵母菌株:EGY48、EGY48(p8op-LacZ\YM4271(EGY48的伴侶菌株)
3.大腸桿菌菌株:KC8株
4.對照質(zhì)粒:
質(zhì)粒用途
pLexA-53,pB42AD-T陽性對照
pLexA-Pos(LexA/GAL4AD融合蛋白〕陽性對照
pLexA-Lam(LaminC蛋白少與其它蛋白相互作用)假陽性檢測質(zhì)粒
5.引物:
pLexA測序引物及pB42AD測序引物。
三、酵母雙雜交實驗的基本流程
1.將報告基因p8op-LacZ轉(zhuǎn)化酵母EGY48菌株,用培養(yǎng)基SD/-Ura篩選。
2.同時構(gòu)建或擴(kuò)增DNA文庫,并純化足夠的質(zhì)粒以轉(zhuǎn)化酵母細(xì)胞。
3.構(gòu)建DNA-BD搬蛋白質(zhì)粒pLexA-X,作為釣餌(bait)。
4.將上述釣餌質(zhì)粒pLexA-X轉(zhuǎn)化EGY48(p8op-LacZ)細(xì)胞株,用SD/-His/-Ura篩
選,并用固體誘導(dǎo)培養(yǎng)基SD/Gdl/Rdf/-His/-Ura檢測此DNA-BD/靶蛋白是否具有直接激
活報告基因的5舌性,以及對酵母細(xì)胞是否具有殺傷毒性。
轉(zhuǎn)化質(zhì)粒選擇培養(yǎng)基克隆生長情況說明
(含有Gal/Raf)
pLexA-PosSD/-His,-Ura藍(lán)陽性對照
pLexASD/-His,-Ura白陰性對照
PlexA-XSD/-His,-Ura白沒有直接激活活性
PlexA-XSD/-His,-Ura藍(lán)具有直接激活活性
PlexA-XSD/-His,-Ura菌落不能生長酵母細(xì)胞毒性
4-1.如果pLexA-X-半孚苜酶的信號作用。能夠自動激活報告基因,則設(shè)法去除
其激活活性部位、或者將LacZ報告基因整合入基因組,減少
4-2.如果pLexA-X雖然不會自動激活報告基因"日對酵母宿中細(xì)胞有毒性,則需要
與純化的文庫DNA同時轉(zhuǎn)化酵母。
5.如果pLexA-X既不會自動激活報告基因也不具有毒性則可以與純化的文庫DNA
同時、或JII頁序轉(zhuǎn)化酵母細(xì)胞,并檢測質(zhì)粒轉(zhuǎn)化效率。
轉(zhuǎn)化質(zhì)粒SD固體培養(yǎng)基LacZ表型
對照1pLexA-PosGal/Raf/-His/-Ura藍(lán)
對照2pLexA-53Gal/Raf/-His/-Trp/-Ura/-Leu藍(lán)
+pB42AD-T
實驗pLexA-XGal/Raf/-His/-Trp/-Ura/-Leu待測
+pB42AD-文庫
5-1.用SD/-His/-Trp/-Ura培養(yǎng)基選擇陽性共轉(zhuǎn)化子,并擴(kuò)增,使宿主細(xì)胞中的質(zhì)粒
在誘導(dǎo)前達(dá)到最大拷貝數(shù)。
-半乳糖首酶無表達(dá)。5-2.上述重組子轉(zhuǎn)至含X-gal的固體誘導(dǎo)培養(yǎng)基
SD/Gal/Raf/-His/-Trp/-Ura/-Leu,觀察LacZ及Leu報告基因的表達(dá)情形,藍(lán)色克隆即
為陽性。白色克隆為假陽性,說明Leu雖有表達(dá),但
5-3.同時用LacZ、Leu兩個報告基因的目的,是為了盡可能消除實驗的假陽性誤差,
望如:AD融合雷白不與目標(biāo)雷白結(jié)合,而直接與啟動子序列結(jié)合域結(jié)合等情況。由于2
個報告基因的啟動子不同,出現(xiàn)上述假陽性的幾率就大大減少了。
5-4.將藍(lán)色陽性克隆進(jìn)行1次以上的劃種,盡可能分離克隆中的多種文庫質(zhì)粒。
6.陽性克隆的篩選
6-1.隨機(jī)選取50個陽性克隆,擴(kuò)增、抽提酵母質(zhì)粒,電轉(zhuǎn)化KC8宿主菌,抽提大
腸桿菌中的質(zhì)粒,酶切鑒定是否具有插入片段及排除相同的文庫質(zhì)粒。
6-2.如果重復(fù)的插入序列較多,可另取50個陽性克隆來分析。最后得到數(shù)種片段大
4環(huán)同的插入序列,再轉(zhuǎn)化新的宿主細(xì)胞,檢測是否仍為陽性克隆。
7.用質(zhì)粒自然分選法(NaturalSegregation)篩除只含有AD-文庫雜合子的克隆
7-1,將初步得到的陽性克隆接種SD/-Trp/-Ura液體培養(yǎng)基,培養(yǎng)1-2天,含有HIS3
編碼序列的BD-靶質(zhì)粒在含有外源His培養(yǎng)基中,將以10%-20%左右的頻率隨機(jī)丟失。
C孵育2-3天。7-2.將上述克隆,轉(zhuǎn)鋪固體培養(yǎng)基SD/-Trp/-Ura,30
7-3.再挑取生長的單克隆,轉(zhuǎn)入SD/-Trp/-Ura和SD/-His/-Trp/-Ura培養(yǎng)基中,篩
選His表型缺陷的克隆,即得到只含有AD-文庫雜合子的重組子。
7-4,將His表型缺陷的克隆轉(zhuǎn)化固體誘導(dǎo)培養(yǎng)基SD/Gal/Raf/-Trp/-Ura以驗證AD-
文庫能否直接激活報告基因的表達(dá),棄去陽性克隆,保留陰性克隆。
8.酵母雜合試驗(YeastMating)確定真陽性克隆
如下表所示,在酵母EGY48及其對應(yīng)的YM4271宿主細(xì)胞中分別轉(zhuǎn)入相應(yīng)的質(zhì)粒或
文庫DNA,通過雜合實驗確篩選pLexA-靶DNA與pB42AD-文庫確實具有相互作用的真
陽性克隆。
質(zhì)粒1
(inYM4271)質(zhì)粒2
(inEGY48)LacZ表型Leu表型
pLexApB42AD白不能生長
pLexA-靶DNApB42AD白不能生長
pLexApB42AD-文庫白不能生長
pLexA-靶DNApB42AD-文庫藍(lán)真陽性
pLexA-LampB42AD-文庫白不能生長
9.陽性克隆的進(jìn)一步篩選和確證
9-1.擴(kuò)增初步確定的陽性克隆,抽提酵母DNA。該DNA為混合成份,既含有酵母
基因組DNA,也含有3種轉(zhuǎn)化的質(zhì)粒DNA。
9-2.將卜述DNA電轉(zhuǎn)化KC8宿主菌。由于在大腸桿菌中,具有不同復(fù)制起始調(diào)捽
序列的質(zhì)粒不相容;同時利用營養(yǎng)缺陷型篩選。因此,在M9/SD/-Trp培養(yǎng)基上,只有含
有AD-文庫質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化菌才能生長,將其擴(kuò)增、并抽提質(zhì)粒DNA,酶切鑒定。
9-3.用pLexA-靶DNA與pB42AD-庫DNA一一對應(yīng)、共轉(zhuǎn)化只含有報告基因的酵
母菌EGY48中,先到SD/-His/-Trp/-Ura板擴(kuò)增,并與后面的誘導(dǎo)板形成對照,說明報
告基因的表達(dá)與誘導(dǎo)AD融合蛋白的表達(dá)有關(guān),再確證LacZ、Leu報告基因的表達(dá)。
9-4.擴(kuò)增與靶DNA相互作用的文庫DNA,進(jìn)行序列分析及進(jìn)一步的結(jié)構(gòu)、功能研
究。
10.對雙雜交系統(tǒng)陽性結(jié)果的進(jìn)一步研究
10-1.用不同的雙雜交系統(tǒng)驗證
將載體pLexA與pB42AD互換后進(jìn)行雙雜交實驗。
10-1-2.選擇不同的雙雜交系統(tǒng),如:以GAL4轉(zhuǎn)錄激活子為基礎(chǔ)的雙雜交系統(tǒng)。
10-1-3.將文庫質(zhì)粒移碼突變后,再與靶質(zhì)粒作用,報告基因是否仍能被激活。
-半乳糖昔酶水平,比較作用強(qiáng)度變化。10-1-4.去除或突變特定結(jié)合位點,定量檢
測
10-2.用試劑盒提供的引物測定插入片段的DNA序列,證明其編碼區(qū)域。
10-3.用其它的檢測方法,如:親和色譜法或免疫共沉淀法來證明雙雜交系統(tǒng)篩選的
蛋白之間的具有相互作用。
10-4.進(jìn)一步研究靶蛋白與篩選蛋白之間的功能關(guān)系
構(gòu)建于AD載體的cDNA文庫的擴(kuò)增
1.自-8CTC冰箱取出含有cDNA文庫的甘油菌,置于冰浴中緩慢化凍。
2.用新鮮的LB培養(yǎng)液在離心管中將上述甘油菌1:106和1:108稀釋。
II加入903.取稀釋菌液各1090mm)37℃倒置培養(yǎng)過夜或30℃培養(yǎng)24-36hr,
計數(shù)平板上單克隆菌落數(shù)。LB培養(yǎng)液在離心管中振蕩混勻,涂布LB/Amp平板(
4.確定待擴(kuò)增的cDNA文庫滴度(cfu/ml)=克隆數(shù)xl08(l:106稀釋)或克隆數(shù)
x1010(1:108稀釋)。
5.按照>150mm),共100塊;37。(:倒置培養(yǎng)過夜。2-4xl04cfu/平板的濃度,涂
布LB/Amp平板(
6.在超凈工作臺上,在所有生長菌落的平板上加適量LB培養(yǎng)液,將菌落刮下,轉(zhuǎn)入
2000mlLB/Amp培養(yǎng)液中,37(振蕩培養(yǎng)2-4hr。
7.留取適量培養(yǎng)菌液以50%無菌甘油稀釋至25%終濃度,分裝,保存于-80℃。
8.其余培養(yǎng)菌液離心8000xgxl0min,4P收集細(xì)菌;用質(zhì)粒DNA純化試劑盒大量
抽提質(zhì)粒DNA。
LB液體培養(yǎng)基,121℃,15lb/in2滅菌15min
A.bacto-Tryptone
B.bacto-YeastExtract
C.NaCI
D.ddH2O-1000ml
*LB固體培養(yǎng)平板為含有%瓊脂(Agar)LB培養(yǎng)基。
**LB/Amp培養(yǎng)基為含有Ampg/ml的LB培養(yǎng)基。50-100
構(gòu)建于AD載體的cDNA文庫的純化
1.質(zhì)粒DNA提取緩沖液
名稱緩沖液配方
g/mlRNasePl懸浮緩沖液50mMTris-HCI;10mMEDTA;100A
P2裂解緩沖液200mMNaOH;1%SDS
P3中和緩沖液Kac
QBT平衡緩沖液750mMNaCI;50mMMOPS;15%異丙醇;%TritonX-100
QC洗滌緩沖液MNaCI;50mMMOPS;15%異丙醇
QF洗脫緩沖液MNaCI;50mMTris-HCI;15%異丙醇
2.培養(yǎng)菌液離心6000xgxl0min,4。(:,每500ml培養(yǎng)物(下同)的沉淀重懸于50ml
Pl緩沖液。
3.加入50mlP2緩沖液,倒置4-6次混勻,室溫孵育5min.
4.加入4。(2預(yù)冷的50mlP3緩沖液,快速倒置4-6次混勻,冰浴30min(其間再倒置
混勻4-6次)。
5.將上述混合液再倒置混勻,離心12000xgx30min,4℃,保留上清。
6.上清再離心12000xgxl5min,4℃,留上清。
7.將上清液上樣于經(jīng)35mlQBT緩沖液平衡的QIAGEN-tip層析柱。
8.以100mlQC緩沖液洗滌層析柱2次。
9.以35mlQF緩沖液洗脫吸附于層析柱上的DNA。
10.以倍體積異丙醇沉浮DNA,離心12500xgx30min,4℃,小心夫除卜清。
11.以7ml70%乙醇洗滌沉淀DNA,離心12500xgxl0min,4℃,小心去除上清。
12.將沉淀的質(zhì)粒DNA溶于5mlTE緩沖液,轉(zhuǎn)移至新的無菌離心管中,用倍體積無
水乙醇;1/10體積NaAc,于-20。(:靜置過夜。
13.離心12500xgx20min,4℃,去除_L清,沉淀用70%乙醇洗滌,超凈臺風(fēng)干。
I),保存于-20。&g/管(用于1次轉(zhuǎn)化反應(yīng),約4014.干燥的DNA溶于適量體
積TE,定量,分裝100-200
構(gòu)建于DNA-BD載體的目的DNA轉(zhuǎn)化酵母感受態(tài)細(xì)胞
1.將酵母菌EGY48(p8op-lacZ)接種于SD/-Ura液體培養(yǎng)基中,緩振打散菌落,然
后轉(zhuǎn)入SD/-Ura液體培養(yǎng)基中,30℃恒溫,250rpm振蕩培養(yǎng)16-18hr,至OD600>e
SD/-Ura液體培養(yǎng)基,115℃,10lb/in2滅菌15min
A.DifcoNitrogen
B.葡萄糖
C.10xDO(-His,-Leu,-Trp,-Ura)
D.20xHis
E.20xLeu
F.20xTrp
G.ddH20-
2.將上述新鮮培養(yǎng)菌液接種于300mlYPD至OD600=約50ml),30℃恒溫250rpm
振蕩培養(yǎng)至OD600=約3h)
YPD液體培養(yǎng)基,115℃,10lb/in2滅菌15min
A.Polypepton
B.bacto-YeastExtract
C.葡萄糖
D.ddH2O-300ml
3.室溫離心5000xgx5min,棄上清加入15-25mlddH2O重懸洗滌沉淀酵母細(xì)胞,
離心棄上清,沉淀用IxTE/LiAc重懸后,即為酵母感受態(tài)細(xì)泡。
4.準(zhǔn)備下列試劑
2x轉(zhuǎn)化反應(yīng)10xTElOxLiAc50%PEGddH2O
II/120I15A.lxTE/LiAc15
I/I960I120B.PEG/LiAc120
II//900C.lxTE100
5.分裝待轉(zhuǎn)化的質(zhì)粒DNA,振蕩混勻。
Ig)3-5A.pLexA-X
B.lOmg/mlISpermDNA*10
*新配制時水浴煮沸20min后,插入冰浴,保存于-20。1
I用IxTE/LiAc重懸的酵母感受態(tài)細(xì)胞,振蕩混勻。6.每管加入100
I7.各加入600PEG/LiAc,振蕩混勻,30℃恒溫,250rpm振蕩培養(yǎng)30mino
I8,各加入70DMSO緩和倒置混勻。42。(2熱休克15min,迅速插入冰浴。
9.室溫離心13000xgxl0sec,盡量棄上清似lxTE重懸沉淀細(xì)胞,涂布SD/-Ura,
-His固體培養(yǎng)板,30。(:倒置培養(yǎng)3-5天。
SD/-Ura,-His固體培養(yǎng)基,115℃,10lb/in2滅菌15min稍冷卻后鋪板
A.DifcoNitrogen
B.
C.10xDO(-His,-Leu,-Trp,-Ura)
D.20xLeu
E.20xTrp
F.Agar
G.ddH2O90-100mm)一鋪8-10塊平板(
附表1.不同規(guī)模轉(zhuǎn)化酵母感受態(tài)細(xì)胞
SmallScale*LargeScaleLibraryScale
轉(zhuǎn)化反應(yīng)2011
(1)SD液體培養(yǎng)基擴(kuò)增醉母菌100ml100ml300ml
(2)YPD液體培養(yǎng)基擴(kuò)增酵母菌300mla300mlalOOOmla
(3)TE或ddH20洗滌酵母細(xì)胞15mlc25-50mlb500mla
(4)準(zhǔn)備A.lxTE/LiAc緩沖液
B.PEG/LiAc緩沖液
C.lxTE緩沖液
(5)分裝A.DNA-BDvectorgdx20/
gd10-50B.ADvector
C.I1x20200SpermDNA(10mg/ml)10
IxTE/LiAc重懸感受態(tài)細(xì)胞
1x20酵母感受態(tài)細(xì)胞100
(7)PEG/LiAc緩沖液x20
Jl1x20700DMSO70
(9)室溫離心后棄上清13000xgxl0sec2000xgx5min2000xgx5min
(10)lxTE重懸感受態(tài)細(xì)胞x20
150mmx50150mmx3090mmx20鋪固體選擇培養(yǎng)基平板
注:*即為"構(gòu)建于DNA-BD載體的目的DNA轉(zhuǎn)化酵母感受態(tài)細(xì)胞”
**在不同容積的無菌離心管中進(jìn)行,a:300或500ml;b:50ml;c:15ml;d:
文庫cDNA轉(zhuǎn)化含有DNA-BD載體的酵母感受態(tài)細(xì)胞
1.以生長于SD/-Ura,-His固體培養(yǎng)板上的含有構(gòu)建于DNA-BD載體的目的DNA
及報告基因(p8op-lacZ)的酵母菌EGY48作為宿主菌,制備酵母感受態(tài)細(xì)胞。
2.將酵母宿主菌接種于SD/-Ura,-His液體培養(yǎng)基中,緩振打散菌落,然后轉(zhuǎn)入
SD/-Ura,-His液體培養(yǎng)基中,30℃恒溫,250rpm振蕩培養(yǎng)16-18hr,至OD600〉。
SD/-Ura,-His液體培養(yǎng)基,115℃,10lb/in2滅菌15min
A.DifcoNitrogen
B.WW?
C.10xDO(-His,-Leu,-Trp,-Ura)
D.20xLeu
E.20xTrp
F.ddH2O-
3.將上述新鮮培養(yǎng)菌液接種于300mlYPD至OD600二約50ml),30℃恒溫250rpm
振蕩培養(yǎng)至OD600=約3hr).
YPD液體培養(yǎng)基,115℃,10lb/in2滅菌15min
A.Polypepton
B.bacto-YeastExtract
C.葡萄糖
D.ddH2O-300ml
4.室溫離心5000xgx5min,棄上清加入15-25mlddH2O重懸洗滌沉淀酵母細(xì)胞,
離心棄上清,沉淀用lxTE/LiAc重懸后,即為酵母感受態(tài)細(xì)抱。
5.準(zhǔn)備下列試劑
lx轉(zhuǎn)化反應(yīng)10xTE10xLiAc50%PEGddH2O
II/800I100A.IxTE/LiAc100
I/I600B.PEG/LiAc600
C.lxTE//
6.取用IxTE/LiAc重懸的酵母感受態(tài)細(xì)胞,加入下列成份,振蕩混勻。
Ig)40A.pB42AD-Library(50-100
B.lOmg/mlIHerringDNA*200
*新配制時水浴煮沸20min后,插入冰浴,保存于-20。匚
7.加入PEG/LiAc,振蕩混勻,30℃恒溫,250rpm振蕩培養(yǎng)30mino
I8,加入700DMSO緩和倒置混勻。42℃熱休克15min,迅速插入冰浴。
9.室溫離心2000xgx5min,盡量棄上清。
10.以100mm,每稀釋度各x2),30°(:倒置培養(yǎng)3-5天,確定轉(zhuǎn)化效率在2xl06cfu
以上有效。I稀釋不同倍數(shù),涂布SD/-Ura,-His,-Trp固體培養(yǎng)板(IxTE重懸沉淀
細(xì)胞,取10
150mmx30),30℃倒置培養(yǎng)3-5天。I涂布SD/-Ura,-His,-Trp固體培養(yǎng)板
(11.按每板200
SD/-Ura,-His,-Trp固體培養(yǎng)基,115。。10lb/in2滅菌15min稍冷卻后鋪板
A.DifcoNitrogen
B.葡萄糖
C.10xDO(-His,-Leu,-Trp,-Ura)
D.20xLeu
E.Agar
F.ddH20150mm)一鋪30塊平板(
12.在超凈工作臺上,在所有生長菌落的平板上各加5mlTE緩沖液,將菌落刮下。
13.離心棄上清,加入10-20mlTE緩沖液重懸沉淀菌,加入等體積的無菌65%甘油
-MgSO4緩沖液,混勻,分裝管,保存于4℃1周或-8CTC1年以L
65%甘油-MgSO4緩沖液:65%甘油;100mMMgS04;25mMTris-HCI
A.甘油
B.MgSO4?7H2O
C.MTris-HCI
D.ddH20-
酵母雙雜合系統(tǒng)陽性克隆的篩選
1.經(jīng)過選擇培養(yǎng)基篩選的含有DNA-BD載體、文庫DNA及報告基因的酵母感受態(tài)
細(xì)胞,用無菌TE稀釋至1:104、1:106和1:108等不同濃度,
90mm),30℃倒置培養(yǎng)3-5天,計數(shù)平板上單克隆菌落數(shù)。I,涂布SD/-Ura,-His,
-Trp固體培養(yǎng)板(2.取上述稀釋菌液各100
3.確定待進(jìn)一步鑒定的酵母菌滴度(cfu/ml)=克隆數(shù)xl05(l:104稀釋)、克隆數(shù)
x107(1:106稀釋)或克隆數(shù)x109(1:108稀釋)。
4.按照以前實驗確定的文庫轉(zhuǎn)化效率的5?10倍的總量、xl06cfu/平板的菌量,涂布
SD/Gal/Raf/-Ura,-His,-Trp,-Leu固體誘導(dǎo)培養(yǎng)板,30℃倒置培養(yǎng)3-5天。
5.挑取顯藍(lán)色的菌落,再接種于SD/-Ura,-His,-Trp固體培養(yǎng)基以及
SD/Gal/Raf/-Ura,-His,-Trp,-Leu固體誘導(dǎo)培養(yǎng)基,以進(jìn)一步確證。
SD/Gal/Raf/-Ura,-His,-Trp,-Leu固體誘導(dǎo)培養(yǎng)基
A.SD/Gal/Raf
B.10xDO(-His,-Leu,-Trp,-Ura)
C.Agar
D.ddH2O-
滅菌(115℃,10lb/in2)15min,冷卻至50℃,加入下列成份后鋪板
E.10xBU
F.20mg/mlX-gal90-100mm)鋪5-6塊平板(
lOxBU緩沖液,121℃,15lb/in2滅菌15min
A.Na2HPO4?12H2O
B.NaH2PO4*2H2O
C.ddH20一
20mg/mlX-Gal
A.X-Gal40mg
B.DMF2ml
酵母雙雜合系統(tǒng)陽性克隆的鑒定
-酵母質(zhì)粒DNA的提取
1.成娥經(jīng)過酵母選擇/誘導(dǎo)培養(yǎng)基初步鑒定的酵母單菌落,接種于SD/-Trp液體培養(yǎng)
基,30℃恒溫,250rpm振蕩培養(yǎng)20"。
SD/-Trp液體培養(yǎng)基,115℃,10lb/in2滅菌15min
A.DifcoNitrogen
B.WH
C.10xDO(-His,-Leu,-Trp,-Ura)
D.20xHis
E.20xLeu
F.20xUra
G.ddH20-
2.室溫離心5000xgxlmin,棄上清,收菌。
I酵母裂解液,振蕩重懸沉淀酵母菌。3.加入200
酵母裂解液:2%TritonX-100;1%SDS;100mMNaCI;10mMTris-HCI;ImM
EDTA
A.10%TritonX-100
B.10%SDS
C.NaCI
D.Tris
E.EDTANa2-2H2O
F.HCI調(diào)
G.ddH20
4.加入下列試劑,充分振蕩5min;液氮凍存lOmin,室溫復(fù)融;再充分振蕩5mino
A.經(jīng)酸處理的玻璃珠(Sigma)
B.苯酚氯仿異戊醇(25:24:1)
5.室溫離心12000xgxl0min,將上清轉(zhuǎn)移至新的離心管中,加入下列試劑,于
-70℃凍存30-60min。
A.3MNaAc(l/10IV)20
IB.無水乙醇500
6.離心12500xgxl0min,4℃,棄上清;70%乙醇洗滌沉淀,于37T烘箱或超凈
臺干燥DNA;將干燥的沉淀DNA重溶于I無菌ddH20中,保存于-20。匚20-30
酵母雙雜合系統(tǒng)陽性克隆的鑒定
-酵母質(zhì)粒DNA電轉(zhuǎn)化大腸桿菌
1.在冰浴條件下,取待轉(zhuǎn)化DNAI感受態(tài)細(xì)胞中,混勻。g),加入100I
F,2002?將上述混合液加入間距的樣品杯中,電轉(zhuǎn)化,25a
3.迅速加入1ml新鮮的LB培養(yǎng)液,混勻,轉(zhuǎn)入離心管中,37℃恒溫,150rpm振
蕩孵育30-60min。
4.將上述轉(zhuǎn)化反應(yīng)液涂布M9/D0(-Trp)固體培養(yǎng)板,37。(:倒置培養(yǎng)至單菌落出現(xiàn)
(16-22hr)0
5.按常規(guī)方法擴(kuò)增上述陽性轉(zhuǎn)化菌,堿裂解法少量抽提質(zhì)粒DNA,酶切篩選AD載
體上含有插入片段的陽性克隆,保存其于25%甘油,待進(jìn)一步驗證。
M9/D0-Trp固體培養(yǎng)基,115℃,10lb/in2滅菌15min
A.葡萄糖
B.Agar
C.5xM9緩沖液60ml
D.10xDO(-His,-Leu,-Trp,-Ura)30ml
E.20xHis15ml
F.20xLeu15ml
G.20xUra15ml
H.ddH2O165ml
冷卻至50℃左右,加入下列成份,混勻鋪板
I.Thiamine-HCIml
J.100mg/mlAmpml90-100mm)鋪10-15塊平板(
大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞的制備(電轉(zhuǎn)化)
1.挑取LB固體培養(yǎng)基上生長的KC8單菌落,接種于5mlLB液體培養(yǎng)基中,37P恒
溫,250rpm振蕩培養(yǎng)過夜(約12-14hr)o
2.將ml新鮮菌液接種于500mlSOB培養(yǎng)液中,37。(:恒溫,250rpm振蕩培養(yǎng)至
OD600;約。
SOB液體培養(yǎng)基,115℃,10lb/in2滅菌15min
A.bacto-Tryptone
B.bacto-YeastExtract
C.NaCI
D.KCI
E.MgCI2*6H2O
F.ddH20
3.將培養(yǎng)菌液收集于離心管中,冰水浴15-20min。
4.離心6000xgxl0min,4℃,棄盡上清;以5ml預(yù)冷的無菌ddH20重懸沉淀菌;
再加入500ml預(yù)冷的無菌ddH2O洗滌細(xì)菌。
5.重復(fù)_L述步驟1次,以充分去除培養(yǎng)基中殘余的鹽離子成份。
6.用40-50ml預(yù)冷的無菌10%甘油重懸沉淀細(xì)菌,轉(zhuǎn)移至50ml無菌離心管中;
離心6000xgxl0min,4℃,棄盡上清;重復(fù)此步驟1次。
7.以等體積(約預(yù)冷的無菌10%甘油重懸上述沉淀的感受態(tài)細(xì)胞,分裝管(5-6次轉(zhuǎn)
化反應(yīng)),保存于-8(TC備用。
酵母雙雜合系統(tǒng)陽性克隆的確證
1.以含有報告基因(p8op-lacZ)的酵母菌EGY48作為轉(zhuǎn)化宿主菌。
2.將酵母宿主菌接種于SD/-Ura液體培養(yǎng)基中,緩振打散菌落,然后轉(zhuǎn)入SD/-Ura
液體培養(yǎng)基中,30℃恒溫,250rpm振蕩培養(yǎng)16-18hr,至OD600〉。
SD/-Ura液體培養(yǎng)基,115℃,10lb/in2滅菌15min
A.DifcoNitrogen
B.
C.10xDO(-His,-Leu,-Trp,-Ura)
D.20xHis
E.20xLeu
F.20xTrp
G.ddH2O-
3.將上述新鮮培養(yǎng)菌液接種于300mlYPD至OD600;約50ml),30℃恒溫250rpm
振蕩培養(yǎng)至OD600=約3hr)。
YPD液體培養(yǎng)基,115℃,10lb/in2滅菌15min
A.Polypepton
B.bacto-YeastExtract
C.葡萄糖
D.ddH2O-300ml
4.室溫離心5000xgx5min,棄上清加入15-25mlddH2O重懸洗滌沉淀酵母細(xì)胞,
離心點上清,沉浮用lxTE/LiAc重懸后,即為酵母感受態(tài)細(xì)胞。
5.準(zhǔn)備下列試劑
20x轉(zhuǎn)化反應(yīng)lOxTElCxLiAc50%PEGddH20
I/I150A.lxTE/LiAc150
B.PEG/LiAc/
C.IxTE//
6.分裝待轉(zhuǎn)化的質(zhì)粒DNA。
A.pLexAIg)3-5orpLexA-X
Ig)3-5B.pB42AD-Y
C.lOmg/mlSpermIDNA*10
*新配制時水浴煮沸20min后,插入冰浴,保存于-20。匚
I用lxTE/LiAc重懸的酵母感受態(tài)細(xì)胞,振蕩混勻。7.每管加入100
各加入振蕩混勻,恒溫,振蕩培養(yǎng)
I8.600PEG/LiAc,30℃250rpm30mino
I9.各加入70DMSO韁和倒置混勻。42℃熱休克15min,迅速插入冰浴.
10.室溫離心13000xgxl0sec盡量棄上清以lxTE
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